Jaapani ainulaadne asukoht ning looduslike ja klimaatiliste tegurite kompleks on viinud selleni, et saartel puudub viljakas maa. Riigil puudub mandriga maismaaühendus. Pikaajalise eraldamise tõttu on mõned Jaapani loomad nii modifitseeritud, et neid klassifitseeritakse alamliikideks.
Jaapani saarte taimed
Ligikaudu 60% Jaapanist on metsadega. Saartel on umbes 2750 taimeliiki, neist 168 on puulised. Vaatamata territooriumi kompaktsele suurusele on riigi kliima heterogeenne. Saarte piires on täheldatud troopikale, subtroopilisele ja parasvöötmele iseloomulikke taimeliike.
Jaapani taimed ja loomad arenesid pikka aega mandrist eraldatuna. See tõi kaasa mõningaid erinevusi liikide evolutsioonis.
Troopiline ja subtroopiline taimestik
Troopilised vihmametsad on tüüpilised Ryukyu saartele. Puuvormidest on levinud järgmised: palmipuud, tsikad, fikus jne. Mändi ja kuuski leidub mägipiirkondades. Saartel on palju viinapuid ja epifüüte, mille hulgas on ülekaalus sõnajalad. O. Yaku on teada, et ta on säilitanud umbes 2000 aastat vanad puud. Nende pikkus on kuni 50 m ja pagasiruumi läbimõõt kuni 5 m.
Mererannik umbes. Kyushu hõivab ka troopilist taimestikku. Sellel saarel võib olla kuni 1 km kõrguseid subtroopiliste puude metsi. Samad taimestiku esindajad on tüüpilised Shikokule ja Honshule (lõunaosa). Domineerivateks liikideks on igihaljad tammed, küpressid, männid, arborvitaed ja muud endeemilised liigid. Alusmetsas võib eristada magnooliaid ja asaleasid. Iidsetel aegadel hõivasid Jaapani saarte lõunaosa loorberimetsad, kus kasvasid peamiselt kamper-loorber, teepõõsas ja Jaapani kameelia. Praegu on neid metsakooslusi alles umbes. Honshu. Neis liikide koostis on mõnevõrra muutunud. Subtroopilises vööndis võib mõnes kohas leida bambuse- ja hõlmikpuuistikuid.
Lehtmetsad
Põhjaosa umbes. Honshu ja lõuna pool Fr. Need metsad on Hokkaido hõivatud. Neis domineerivad tammed, pöögid, kastanid, vahtrad, pärn, tuhk, sarvpuu ja muud puittaimed. Mägede nõlvad on leht- ja okaspuumetsade tsoon. Viimaseid tähistavad krüptomeeriad, tsuga, jugapuu jne.
Umbes. Hokkaidos, merepinnast 0, 5 km kõrgusel, asendab seda taimekooslust kuusk ja bambuse segu. Osa mäetippudest asub väljaspool metsavööndit. Neid okupeerivad spetsiaalsed taimekooslused, mille hulka kuuluvad seedripuu, rododendron, kanarbik jne.
Inimtekkeline mõju Jaapani taimestikule ja loomastikule on piiratud territooriumi ja tihedalt asustatud alade tõttu üsna suur. Lagedaid metsi vähendatakse ja nende asemele luuakse põllumaad.
